Wisemapping, buena aplicación de mapas mentales online.
mind42, otra buena aplicación online, ésta es alemana, bastante intuitiva y tiene incorporado gtalk y skype.
Mindomo, otra aplicación, ésta de pago pero con una cuenta básica gratuita.
Mindmeister, una de las opciones online más conocidas, de pago pero con versión gratuita de hasta 6 mapas activos.
The Brain, aplicación bastante visual, con flash, pero de pago, versiones para linux, mac y windows y versión limitada gratuita.
CmapTools, otra aplicación bastante completa, con versión cliente y servidor y gratuita para uso personal y fines educativos.
Freemind, la mejor aplicación, de uso local, programada en java y con versiones para linux, mac y windows, es software libre.

Añadido para Freemind para integrar del.cio.us en el mismo
Tutorial de la instalación de Freemind en Debian/Ubuntu
Thinkature, mezcla de mapa mental y herramienta de colaboración online, integra chat de voz, perfecto para trabajos distribuidos o dar clase.
Flowchart, herramienta para creación online de diagramas de flujo, usados sobre todo en programación y desarrollo, exporta a pdf y png.
Ofrece una manera de crear su organigrama en línea. Sin instalar ningún software. Sin descargas. Ningún Plugin requerido.
Zotero, extensión de Firefox para la gestión de fuentes de información.

Gtdgmail, extensión para Firefox que integra la filosofofía GTD (Get things done) en Gmail.





